W ramach działalności programowej Park wytycza ścieżki przyrodniczo-dydaktyczne. Ich przebieg pokrywa się przeważnie z polączonymi w jedną całość fragmentami szlaków turystycznych. Natomiast w szczególnie ciekawych miejscach stworzono tzw. przystanki (numerowane), na których ustawiono tablice poglądowe, informujące na jakie elementy krajobrazu, przyrody czy dziedzictwa kulturowego warto zwrócić uwagę. Na opisywanym terenie znajdują się trzy takie ścieżki.
I. W rejonie Pilska, której przebieg wyznaczają przystanki:
1. Korbielów Kamienna, 2. Polana Macicowa. Górskie pastwiska, 3. Góra Szlakówka. Sztuczna świerczyna, 4. Młaka pod Halą Komieniecką. Stanowisko tojadu mocnego i roślin torfowiskowych, 5. Hala Miziowa. Rozległa polana na terenie osuwiskowym, 6. Górna granica lasu i biogrupy świerkowe, 7. Piętro subalpejskie. Zarośla kosodrzewiny i wysokogórskie zbiorowiska krzewinkowe, 8. Mogiła żołnierza. Zarośla jarzębinowe w piętrze kosodrzewiny, 9. Bór górnoreglowy. Rozpadliny skalne. Stanowisko limby, reliktowa flora naskalna, 10. Góra Gawory. Sztuczna świerczyna w reglu dolnym, 11. Hala Malorka. Łąka reglowa z dominacją śmiałka darniowego. Stanowisko dzwonka lancetowatego, 12. Hala Uszczawne. Fragmenty buczyny karpackiej. Pastwiskowe formy buków, 13. Przełęcz Przysłopy. Kwiecista łąka reglowa. Stanowisko mieczyka dachówkowatego, 14. Wodospad w Sopotni Wielkiej.
II. W rejonie Romanki i Lipowskiej, której przebieg wyznaczają przystanki:
1. Węgierska Górka centrum, 2. Węgierska Górka Forty, 3. Żabnica, 4. Abrahamów, 5. Romanka, 6. Lipowska, 7. Hala Redykalna, 8. Hala Boracza, 9. Prusów.
III. W rejonie Ujsołów, której przebieg wyznaczają przystanki:
1. Ujsoły centrum (przystanki 2-7 znajdują się poza terenem objętym przewodnikiem), 8. Glinka, 9. Kubie-sówka, 10. Krawców Wierch, 11. Wielki Groń, 12. Trzy Kopce, 13. Lipowska, 14. Kręcichwosty, 15- Zlatna centrum, 16. Złatna Huta, 17. Dolina Straceńca, 18. Ujsoły Składy.
System ochrony przyrody na Słowacji różni się nieco od polskiego. Dotyczy to przede wszystkim form ochrony przyrody. Do wielkoprzestrzennych form ochrony przyrody na Słowacji należą:
— Narodny park (NP) czyli park narodowy,
— Chranena krajinna oblast’ (CHKO) czyli Obszar Chronionego Krajobrazu.
Mniejsze przestrzenne formy ochrony to:
— Śtatna prfrodna rezervacia (ŚPR) — państwowy rezerwat przyrody,
— Chranene nalezisko (CHN) — stanowisko ochronne,
— Chranena śtudijna płocha (CHŚP) — ochronna przestrzeń badawcza.
Ponadto funkcjonują:
— Chraneny prirodny vytvor (CHPV) — chroniony twór przyrody,
— Chranena prirodna pamiatka (CHPP) — chroniony zabytek przyrody.
Podobnie jak w Polsce najwyższą formą ochrony jest park narodowy i rezerwat przyrody. Natomiast nie tworzy się na Słowacji parków krajobrazowych. W Polsce z kolei poza podziałem rezerwatów na ścisłe i częściowe nie stosuje się takich form ochrony jak CHN i CHŚP, które w istocie rzeczy są rodzajami rezerwatów. CHPV natomiast może być bądź odpowiednikiem naszego rezerwatu, bądź też, jeśli chroniony jest obiekt a nie większa przestrzeń — odpowiednikiem pomnika przyrody. CHPP z kolei to obiekt przyrodniczy, z którym wiąże się jakieś wydarzenie historyczne, podanie czy legenda. Zarówno w Polsce, jak i na Słowacji wytycza się ścieżki dydaktyczne, które u naszych południowych sąsiadów określane są nazwą — Naućny chodnik (NCH). Jednak na omawianym obszarze Górnej Orawy brak ścieżek dydaktycznych.
Na omawianym terenie brak parków narodowych, natomiast znajduje się tutaj rozległy Obszar Chronionego Krajobrazu „Górna Orawa” (CHKO „Homa Orava”), utworzony w roku 1978.
Na opisywanym terenie Górnej Orawy zlokalizowanych jest osiem rezerwatów: Beniadowskie Torfowisko (CHN), Kliniańskie Torfowisko (ŚPR), Mutniańskie Torfowisko (CHN), Pilsko (ŚPR), Ptasi Ostrów (CHPP), Slanicki Ostrów (CHPP), Spalony Grunik (CHN) i faskovka (CHPV). Szczegółowy opis — patrz słowniczek.
Wśród pomników przyrody liczne są zabytkowe drzewa, najczęściej lipy przy kościołach i kapliczkach.